V tihi dolini, ki jo obrobljata potoka Toplica in Prinovec, tik pod hotelom, se nahaja več termalnih vrelcev. Nad enim od njih, blizu sedanjega lotosovega jezerca, je Alojzij Zajec pred 100 leti zgradil kopališko stavbo, nad drugim, na koncu doline, pa je preprosto jezerce, ki je že imelo leseno dno, spremenil v bazen. Ta bazen ni bil niti betoniran niti obložen s keramiko, temveč je bilo njegovo dno iz zbite ilovice pokrito s smrekovimi deskami, ogrodje pa je bilo iz hrastovih plohov. Za lesen bazen niso bili potrebni nikakršni kemični premazi in bil je pretočen, zato se je voda v njem v celoti zamenjala v nekaj urah, s tem pa sta se v največji možni meri ohranjali tako temperatura vode kot tudi njena vsebnost zdravilnih sestavin.

Naslednji lastniki toplic, družina Gregorić, so v kopališču, to je pri sedanjem lotosovem jezercu, leta 1926 uredili vodovodno in električno napeljavo in obnovili so gostilno in mlin, bazeni pa so dobili imena: Marijina kopel (sedanji leseni bazen), Aleksandrova kopel (večja zaprta kopel) in Petrova kopel (manjša zaprta kopel).

Hiter razvoj Term Šmarješke Toplice v zadnjih desetletjih prejšnjega stoletja je narekoval še izgradnjo notranjih bazenov in izplavnega bazena v hotelu, zato so prvotno kopališko stavbo podrli in zgradili novo ob lesenem bazenu, zgrajena pa sta bila tudi velik športni bazen in otroški bazen.

Leseni bazen še vedno omogoča razvajanje tik nad vrelcem zdravilne termalne vode, in to pod krošnjami in ob ptičjem petju.

Prenova lesenega bazena leta 2010

Zaradi močvirnatega terena je bazensko školjko načel zob časa, in je bila zato pred 12-imi leti postavljena na nove lesene pilote in oblečena v masivno oblogo iz zelo obstojnih vrst lesa, najodpornejših proti zunanjim vplivom. Obnovljeni leseni bazen obdaja zdaj lepa terasa iz lesa in tlakovcev, ki ponuja ležalno površino za približno 50 ljudi. Kopanje in počitek ob lesenem bazenu sta nadvse prijetno doživetje, saj ponujata bližnji potok in gozd pristen stik z naravo, svežino in naravno senco, pri bazenu pa sta na voljo tudi dve masažni kadi, ki gostom zagotavljata mir in zasebnost.

V večernih urah je okolica bazena diskretno osvetljena in vabi na posebna večerna druženja za zaključene skupine.

Sistem za pripravo vode (strojnica bazenske tehnike s pripadajočo tehnologijo in napravami za dezinfekcijo kopalne vode) je zdaj sodobno urejen po zakonskih določilih, v skladu z ekološkim in naravi prijaznim delovanjem pa so na streho bazenskega objekta nameščeni tudi sončni kolektorji, ki pomagajo ohranjati temperaturo kopalne vode nespremenjeno – 32 stopinj Celzija. Ob ugodnem vremenu je bazen tako na voljo za kopanje vso poletno sezono, praviloma od maja do sredine septembra.

V votlini pri lesenem bazenu  je družina Gregorić v prvi polovici 20. stoletja postavila kapelico. Na kamnitem podstavku je stal osvetljen kip Lurške Matere Božje, pod njim pa je žuborela voda. Po 2. svetovni vojni je izpraznjeno votlino preraslo zelenje ... V spomin na začetke zdraviliškega turizma je Občina Šmarješke Toplice kapelico leta 2013 obnovila.